Время возникновения архивов на территории современной Омской области совпадало с основанием городов, крепостей, слобод.
С 1594г. формировался архив Тарской приказной избы.
Но Г.Ф.Миллер, побывавший в Таре в 1734г. едва смог набрать 97 древних документов. Многочисленные пожары уничтожили практически всё.
В старом Омске существовали крупные массивы документов, их называли архивами, и среди них – Омский областной архив, принадлежавший Акмолинскому областному правлению. Здесь были сосредоточены документы Военно-походной канцелярии командира Сибирского корпуса 1745-1800гг.,

Пограничного управления сибирских киргизов, материалы о сношениях с Киргизской степью.
Для него по ул.Александровской,9 было построено специальное здание. С уникальными документами этого архива работали Ч.Валиханов, Г.Потанин, П.Золотов, Г.Катанаев, Ф.Усов и другие именитые исследователи. Здесь позднее размещался и архив Степного генерал- губернаторства.
Г.Н.Потанин, вспоминая о своей работе в областном архиве, писал: ”В архиве много интересных сведений о сношениях русских пограничных начальников с киргизскими родоначальниками и князьями Джунгарского ханства, а также о торговле между Сибирью и городами Восточного Туркестана. В этом архиве заключается документальная история последних дней существования Джунгарского ханства”.

Но события гражданской войны привели к массовому уничтожению документов – были разгромлены архивы Акмолинского областного правления, Омского военно-окружного суда, штаба Омского военного округа, уничтожены часть жандармских, полицейских и тюремных архивов.

За 1920-1923 годы в губархив поступило 112 фондов в неразобранном виде, поэтому необходимо было привести эти массы документов в порядок, чтобы можно было их использовать.
Восемь вагонов документов было отправлено в Москву. Подготовка и отправка фондов в центр продолжалась и в последующие годы. В Москву, в книжную палату направлялась и местная литература.
Осенью 1924 года фонды архива, размещенные ранее в шести помещениях, были переведены в одно архивохранилище Дома Советов. К этому времени в архиве было 90500 кг. неразобранных документов.
В 1925 году создается научно-справочная библиотека архива, в которой насчитывается 4350 экз. краеведческой и другой литературы.

В 1978 году архив переехал в новое здание по ул.Третьяковская,1.

Постановлением правительства Омской области от 9 марта 2004 года ГАОО был преобразован в государственное учреждение Омской области “Государственный архив Омской области”.
На этот период в его архивохранилищах содержалось  3253 фонда, 1 010 680 ед.хр. с 1722 года.. Среди фондов: “Сибирский генерал-губернатор” (1803-1822 годы), “Главное управление Западной Сибири” (1822-1882гг.), “Омская Духовная консистория” (1722-1921гг.); фонды личного происхождения: А.С.Сорокина – сибирского писателя, Г.Е.Катанаева – историка Сибирского казачьего войска и исследователя, омского актера Н.Д.Чонишвили.

В конце 1980-х годов началось активное рассекречивание документов, и информационная база ГАОО расширилась более чем на 40 тыс. ед.хр.
Среди документов, переданных на открытое хранение, - уголовные дела на граждан, осужденных за религиозные убеждения, службу в контрреволюционной армии, агитацию против продразверстки и т.п. Значительная часть этих дел легла в основу 10-томного издания книги Памяти жертв политических репрессий “Забвению не подлежит”.
Кроме того по рассекреченным делам в настоящее время готовится новая Книга Памяти, но уже на граждан, подвергшихся раскулачиванию и выселению за “болота”.
Проводилась в архиве работа по выявлению уникальных документов.
На начало 2008 года выявлено и включено в Государственный реестр УД Омской области 53 документа, среди которых:
Ведомость городов, крепостей, редутов, форпостов и т.п. Омской области, переписка об учреждении женского монастыря близ пос. Ачаир, ревизская сказка 1858 года жителей города Омска, актовые записи о рождении Героя Советского Союза Д.М.Карбышева, великого русского художника М.А.Врубеля и др.

  В результате реорганизации двух архивных учреждений порядка 4.800 фондов (около 663 тыс. дел постоянного срока хранения) бывшего Центра документации новейшей истории Омской области стали составной частью фондов ГУ ИсА.

В первую очередь, это документы фонда Омского Истпарта (Комиссии по изучению истории Октябрьской революции и РКП/б/): протоколы партийных конференций и собраний, прокламации и листовки социал-демократи-ческих организаций, газеты и журналы центральных и местных органов власти послереволюционного периода, в частности, "Известия Омского губкома РКП", "Красный путь" (издание Омгуббюро РКП), Бюллетени Омского губисполкома.
Самым большим по объему является комплекс документов, создававшихся в деятельности местных партийных и комсомольских органов за 1919 - 1991 гг. Это фонды губкомов, окружкомов, обкомов, райкомов КПСС и ВЛКСМ, партколлегий и контрольных комиссий по партчистке, первичных партийных и комсомольских организаций. Документы - протоколы и отчеты руководящих органов, докладные записки, информации с мест и другие - содержащие сведения о проведении социалистической индустриализации и коллективизации сельского хозяйства в Западной Сибири, об эвакуации в Омскую область предприятий и учреждений и развитии здесь оборонной промышленности, о сборе средств и подарков для Красной Армии и помощи районам, освобожденным от оккупации. Большой блок составляют документы о послевоенном развитии области: освоении целинных и залежных земель, развитии нефтехимической промышленности, открытии новых учебных заведений и объектов здравоохранения - свидетельства превращения     Омска в крупный промышленный и культурный центр Сибири.

Несомненный интерес для исследователя представляют архивные коллекции документов и фотографий по Великой Отечественной войне, в том числе о формировании в Омске в годы войны воинских соединений, таких как 308-я Гуртьевская дивизия, 75-я Гвардейская бригада и др. Документы – материалы о боевом пути формирований, о работе Омского отделения Совета ветеранов войны, личные документы участников и ветеранов, схемы, карты, листовки военного времени, справки, письма с фронта, воспоминания участников боёв, стихи и рисунки, фотоснимки военного и послевоенного времени.
Особый комплекс составляют документы современных общественных и политических организаций. Это фонды областных профсоюзных комитетов, научных медицинских обществ, редакций газет, молодежных и спортивных организаций (ДОСААФ, Омский областной скаутский центр «Сибирь» и др.), общественных организаций (Общество охраны памятников и истории и культуры, Красный крест и др.), политических партий («Единая Россия», КПРФ, ЛДПР и др.).
И, наконец, это значительная по объему (21800 фотоснимков) коллекция фотодокументов по советской и постсоветской истории Омска и Омской области, в том числе по Великой Отечественной войне.
Документы бывшего Центра документации новейшей истории Омской области хранятся по старому адресу реорганизованного учреждения, а именно: ул. Певцова, 9.

Для работы исследователей по фондам Омского Испарта и Омского партархива, областных, городских и сельских руководящих партийных и комсомольских органов, а так же фондам парткомов крупных омских предприятий, общественных организаций по-прежнему  работает читальный зал, расположенный в бывшем Центре документации новейшей истории Омской области (ул. Певцова, 9). Здесь же можно поработать с личными фондами членов партии, комсомола.

На севере Омской области в городе Таре находится филиал ГУ ИсА,

который был создан в 1933 году как Тарский окружной архив, преобразованный в 1944 году в филиал областного архива.

Архив находится в новом здании, построенном в 1994 году. Всего в архивохранилищах насчитывается 716 фондов, 113 005 ед.хр.
Здесь хранятся документы учреждений и организаций Тарского уезда и округа, а также документы семи северных районов области: Большеуковского, Знаменского, Колосовского, Седельниковского, Тарского, Тевризского, Усть-Ишимского.
Наиболее ранним (с 1822 г.) является фонд Тарской поземельно -устроительной партии. Интерес для исследователей представляют фонды: “Заведующий водворением переселенцев в Тарский район”, “Тарская мужская гимназия”, коллекции документов участников Великой Отечественной войны, Почетных граждан г.Тары, а также личные фонды архивиста и краеведа Л.В.Перевалова, историка Жирова А.А., краеведа Юрьева А.И. и др.